自然教育中心主館仿四合院形式建築,由東南西北四條走廊連接,中央為天井花園,除辦公室及詢問處佔用一角外,其餘為三個獨立展覽館:
獅子會自然教育中心設有「昆蟲館」、「貝殼館」、「漁館」、「農館」和「地質公園遊客中心」等展覽館,並設有戶外場地展示動植物標本和有機耕種農作物。